О, вот это по делу.

> Блоки элементов с разным выравниванием "пляшут"

Соглашусь, иногда встречается. Но всё реже, уже почти всё причёсано. Spectacle ещё нуждается в причёсывании, да.

> 3-х слойное меню

Не очень понял.

> 2-х слойные статусбары

Один. Один двухслойный статусбар. В Kate, который с замашками IDE, где интерфейс сложно сделать простым и при этом не угробить функционал. Нужен редактор без наворотов — есть KWrite: https://i.imgur.com/8ZHTKr8.png

> вертикальный текст

Соглашусь. Но опять же — кроме Kate я не припомню, чтобы это было где-то ещё. А про Kate см. выше.

> эмодзи в консолях - я надеюсь оно не будет куски скрипта превращать в кашу смайликов?

Не знаю. Но если будет — это не про дизайн, это будет баг.

> иконки не адаптированы под темный фон - наверно и темные темы будут поломаны

Это как? Значки обычно определяются темой оформления, поменяете на тёмную, будут соответствующие значки.