> jfs прикольная, но незаслуженно забытая.

В ней просто нет ничего интересного. Обычная файлушка. Довольно слоупочная. Продвинутости по целостности данных не умеет, дефрага нет, reflinks нет, ну и в целом - оно как бы работает. Но как бы единственный реальный плюс - мизерная нагрузка на проц. Аргумент только для винча в usb роутера с хилым процом, разве что - качать на него торенты какие. Для всего остального можно ФС получше подобрать.

> со временем копилось что-то сильно. Вроде и экстенты есть, но почему-то
> через годик-другой эксплуатации реально тормозить начинало.

Да он и изначально по скорости звезд с неба не хватает.

> Возможно даже не сами данные, а метаданные по большим файлам фрагментировались,

Он вообще с метаданными работает не сказать что сильно быстро.

> приятный эффект, особенно на многодисковых рейдах.

Да он и на однодисковых конфигах далеко не чемпион по скорости. Вообще ни в какой из номинаций. При том если какому-нибудь btrfs это можно простить за фичи то тут это нечто типа ext4 тормознутого. Даже хуже, если по фичам.