есть такой ресурс dev.mysql.com
на нем же есть поиск если забить slow query, то он вам выдаст ссылку http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/slow-query-log.html, там ыв получите часть ответовпо поводу узкого места, там же читайте раздел optimization
http://www.mysqlperformanceblog.com/
Вообще офф.дока полезная вещь...
>[оверквотинг удален]
>3. как они живут в системе? вот сформировался запрос, выполняется какое-то время
>и затем определяется как "медленный" и что с ним происходит дальше?
>он завершается или продолжает висеть?
>4. вытекает из 3-о, команда mysqladmin status в выоде показывает Slow queries:
>n, это счетчик медленных запросов с момента запуска mysqld или их
>количество в данный момент?
>5. какой может быть ущерб от этих медленных запросов?
>
>ps. в гуглк смотрел, там всё пишут о том как включить лог
>медленных событий, не вижу проку от это лога