Статья "An Introduction to GraphViz" подробно описывает назначение пакета GraphViz и демонстрирует несколько примеров генерации графиков различных видов (иерархические связи, блок-схемы, UML диаграммы), как при помощи утилит командной строки (описание структуры задается на специальном псевдоязыке "dot"), так и рисования непосредственно из Perl скриптов.

В другой статье "Visualize function calls with Graphviz" показано как построить дерево выполненных из программы библиотечных вызовов.