Есть два сервера под Linux/FreeBSD: СУБД MySQL + некое приложение,
задача - синхронизировать БД и данные.

За синхронизацию данных MySQL отвечает mysql replication, данные
синхронизируются с мастера на слейв.

Делаем на мастере:

в my.cnf добавляем строки

   log-bin = /var/log/mysql/mysql-bin.log
   binlog-do-db=databasename
   server-id=1

перезагружаем MySQL, добавляем пользователя для репликации:

   GRANT ALL PRIVILEGES ON databasename.* TO 'slave_user'@'%' IDENTIFIED BY 'slave_password';
   FLUSH PRIVILEGES;

далее выполняем команду:

   USE databasename;
   FLUSH TABLES WITH READ LOCK;
   SHOW MASTER STATUS;

и вывод этой команды для нас важен, надо его куда-нибудь записать:

   | File | Position | Binlog_do_db | Binlog_ignore_db |
   | mysql-bin.001 | 10 | databasename | |

теперь делаем дамп базы:

   mysqldump -u slave_user -pslave_password --opt databasename > databasename.dump

и наконец убираем лок с базы в MySQL:

   UNLOCK TABLES;


Теперь на слейве:

Создаём базу:

   mysqladmin create databasename -p

Востанавливаем базу из дампа:

   mysql -u slave_user -pslave_password databasename < databasename.dump

в my.cnf добавляем строки:

   server-id=2
   master-host=XX.XX.XX.XX # IP адрес мастер-сервера
   master-user=slave_user
   master-password=slave_password
   master-connect-retry=60
   replicate-do-db=databasename

перегружаем MySQL и добавляем чудесные данные из волшебной комманды:

   SLAVE STOP;
   CHANGE MASTER TO MASTER_HOST='XX.XX.XX.XX',
     MASTER_USER='slave_user', MASTER_PASSWORD='slave_password',
     MASTER_LOG_FILE='mysql-bin.001', MASTER_LOG_POS=10;
   START SLAVE;

готово, теперь проверяем, добавляем запись в мастер, на слейве она должны отреплицироваться.

Понятно, что изменять данные можно только на мастере, слейв работает только на чтение.


Для синхронизации данных имеет смысл использовать rsync, очень интересный протокол/приложение. 
Может синхронизировать инкрементально и с сжатием.
На мастер сервере в rsyncd.conf добавляем:

   read only = yes # во избежание ;-)
   hosts allow = YY.YY.YY.YY # IP адрес слэйв-сервера
   [somelabel]
   path = /path/to/apllication/folder # где лежит приложение
   auth users = replica_user # юзер только для репликации в rsync, не системный пользователь
   secrets file = /path/to/rsync/rsync.secret # где лежит файл с паролем для replica_user, 
                                              # только пароль и ничего больше

на слейве - команда для синхронизации, можно добавить в cron с нужной периодичностью:

   /path/to/rsync -avz --exclude-from=/path/to/rsync.exclude \
     --password-file /path/to/rsync.secret \
     rsync://replica_user@XX.XX.XX.XX:873/somelabel /path/to/application

где:
rsync.exclude - файл в котором перечислены, какие файлы (конкретно или по
маске) не синхронизировать
rsync.secret - файл с секретным паролем для replica_user
ХХ.ХХ.ХХ.ХХ - IP мастер-сервера, 873 - дефолтный порт для демона
somelabel - метка из rsyncd.conf с мастера
/path/to/application - путь куда класть данные.