Установка десктопных дистрибутивов с USB-накопителей обычно не вызывает особых проблем, 
UNetBootin есть и под Windows и под Linux, кроме того, есть ещё несколько способов изготовления 
загрузочных "флешек". Для серверного дистрибутива Ubuntu этот способ не
подходит. Программа установки запускается,
всё проходит гладко до монтирования привода CD-ROM и на этом заканчивается. Ни
ручное монтирование привода,
ни использование стандартных драйверов 
не помогает, что в общем-то естественно, CD-ROM’а-то нет. В итоге, выход
нашёлся на официальном help’е Ubuntu.

И вот, что в итоге нам понадобится для создания "правильно" установочной
"флешки" для Ubuntu Server:

   1. Собственно сам ISO-образ Ubuntu Server
   2. initrd.gz (http://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/jaunty/main/installer-amd64/current/images/hd-media/initrd.gz)
   3. wmlinuz (http://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/jaunty/main/installer-amd64/current/images/hd-media/vmlinuz)
   4. Flash-накопитель от 1 Гб и больше

Если будете ставить другую версию или другую целевую платформу, то ссылки будут другие.

Ещё нам понадобится небольшой скрипт:

    # Replace "sdx" with "sdb" or whatever your flash drive is
    #   - If unsure which device is your flash drive then
    #     run "sudo fdisk -l | less" in order to identify it

    ISOIMAGE=ubuntu-9.04-server-amd64.iso

    sudo apt-get install syslinux mtools mbr
    echo "Use fdisk to manually create a 1GB bootable FAT16 partition."
    read -p "Press [Enter] to start the fdisk program..."
    # sudo fdisk /dev/sdx
    # sudo mkfs -t vfat /dev/sdx1
    sudo mkdir -p /mnt/flash
    sudo mount -t vfat /dev/sdx1 /mnt/flash
    sudo syslinux -s /dev/sdx1
    sudo mkdir -p /mnt/iso
    sudo mount -o loop $ISOIMAGE /mnt/iso
    sudo cp -R /mnt/iso/isolinux/* /mnt/flash
    sudo mv /mnt/flash/isolinux.cfg /mnt/flash/syslinux.cfg
    sudo mkdir -p /mnt/flash/install
    sudo cp vmlinuz /mnt/flash/install
    sudo cp initrd.gz /mnt/flash/install
    # clear pool directory, which is unnecessary for installation
    # that enables installation on 1G flash; remove if installing on
    # bigger devices and you run into problems
    sudo rm -rf /mnt/flash/pool
    sudo cp $ISOIMAGE /mnt/flash
    sudo install-mbr /dev/sdx
    sudo umount /mnt/flash
    sudo umount /mnt/iso

Копируем его, вставляем в любимый текстовый редактор. Переменной $ISOIMAGE
присваеваем имя ISO-образа,
а все упоминания sdx заменяем на имя устройства флешки (обычно sdb, если у Вас
один физический диск).
Сохраняем полученный файл в директории и выполняем:

    chmod +x script
    sudo ./script

Во время работы скрипта изначально был прописан запуск fdisk и переформатирование, 
но для стандартных, уже отформатированных под FAT32 флешек, делать это не обязательно.