Инструкция по чистке штатного окружения GNOME и вырезания всего лишнего.

Изменяем настройки через dconf, например, устанавливаем тему оформления,
отключаем звуковые уведомления, включаем показ даты на часах, полностью
отключаем все пользовательские дополнения, отключаем проверку обновлений,
настраиваем переключение раскладки по клавише Caps Lock, убираем мигание
курсора и т.п.

   dconf write '/org/gnome/desktop/input-sources/xkb-options'  "['grp:caps_toggle']"
   dconf write '/org/gnome/desktop/interface/clock-show-date'  'true'
   dconf write '/org/gnome/desktop/interface/cursor-blink' 'false'
   dconf write '/org/gnome/desktop/interface/gtk-theme'  "'Adwaita- dark'"
   dconf write '/org/gnome/desktop/privacy/old-files-age' 'uint32 7'}
   dconf write '/org/gnome/desktop/privacy/remove-old-trash-files' 'true'
   dconf write '/org/gnome/desktop/privacy/report-technical-problems'     'false'
   dconf write '/org/gnome/desktop/search-providers/disable-external'  'true'
   dconf write '/org/gnome/desktop/wm/preferences/audible-bell' 'false'
   dconf write '/org/gnome/desktop/wm/preferences/focus-mode' "'sloppy'"
   dconf write '/org/gnome/settings-daemon/plugins/color/night-light-enabled'  'true'
   dconf write '/org/gnome/settings-daemon/plugins/xsettings/antialiasing' "'rgba'"
   dconf write '/org/gnome/shell/disable-user-extensions'  'true'
   dconf write '/org/gnome/software/allow-updates' 'false'
   dconf write '/org/gnome/software/download-updates' 'false'
   dconf write '/org/gnome/terminal/legacy/default-show-menubar'  'false'

Удаляем излишества, такие как демон поисковой индексации Tracker, почтовый
клиент Evolution, средства интеграции с online-службами, каталог приложений
GNOME Software и специфичные приложения GNOME, такие как Totem и GNONE Photos.

Например, в Fedora 28 можно удалить пакеты:

  dnf remove cheese
  dnf remove evolution
  dnf remove evolution-ews
  dnf remove evolution-help
  dnf remove gfbgraph
  dnf remove gnome-boxes
  dnf remove gnome-calendar
  dnf remove gnome-contacts
  dnf remove gnome-dictionary
  dnf remove gnome-documents
  dnf remove gnome-getting-started-docs
  dnf remove gnome-initial-setup
  dnf remove gnome-maps
  dnf remove gnome-online-miners
  dnf remove gnome-photos
  dnf remove gnome-software
  dnf remove gnome-user-docs
  dnf remove gnome-user-share
  dnf remove gnome-video-effects
  dnf remove gnome-weather
  dnf remove simple-scan
  dnf remove totem
  dnf remove tracker-miners
  dnf remove yelp

На всякий случай проверим, чтобы случайно не удалить ключевые зависимости:

   dnf install eog evince evolution-data-server flatpak gdm gnome-keyring gnome-menus \
     gnome-screenshot gnome-shell gnome-terminal gnome-tweaks nautilus redhat-menus


Пакеты evolution-data-server и tracker связаны зависимостями с базовыми
компонентами GNOME и удалить их не получится. Поэтому ограничимся отключения
связанных с ними сервисов:

   systemctl --user mask evolution-addressbook-factory.service
   systemctl --user mask evolution-calendar-factory.service
   systemctl --user mask evolution-source-registry.service
   systemctl --user mask gvfs-goa-volume-monitor.service
   systemctl --user mask tracker-store.service

Удаляем БД tracker:

   rm -rf ~/.cache/tracker

В настройках Firefox отключаем плагин интеграции с GNOME Shell и меняем тему оформления, в user.js:

   user_pref("plugin.state.libgnome-shell-browser-plugin", 0);
   user_pref("widget.content.gtk-theme-override", "Adwaita:light");

При желании в Firefox можно использовать https://github.com/pyllyukko/user.js с
настройками для обеспечения максимальной безопасности и блокирования
отслеживания (отключены WebRTC, webGL, Web Audio, Service/Web Workers, User
Timing, mozTCPSocket, Pocket, telemetry  и т.п.).