В 5'ке из-за GEOM'а есть защита от изменений в таблице партиций
на уже установленной системе. 
Например, ругается:

   ERROR: Unable to write data to disk amrd3

Вот из-за этого и нельзя записать информацию в таблицу партиций.

Решение:
вариант 1:

   - смотрим переменную ядра: sysctl kern.geom.debugflags
   - устанавливаем в следующее значение для разрешения записи в таблицу партиций: 
      sysctl kern.geom.debugflags=16
   - теперь можем вручную конфигурить диски, массив и писать в таблицу
партиций

   тонкость: не используй sysinstall - даже при установленной переменной
kern.geom.debugflags=16 эта утилита не позволит записать в таблицу.

вариант 2:

   - если хочешь использовать именно sysinstall - грузись с CD
и используй sysinstall